Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS7

Nphs1, Nephrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphs1Q9QZS7 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nphs1Q9QZS7 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nphs1Q9QZS7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nphs1Q9QZS7 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nphs1Q9QZS7 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nphs1Q9QZS7 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nphs1Q9QZS7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Nphs1Q9QZS7 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nphs1Q9QZS7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nphs1Q9QZS7 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nphs1Q9QZS7 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nphs1Q9QZS7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nphs1Q9QZS7 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nphs1Q9QZS7 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nphs1Q9QZS7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nphs1Q9QZS7 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nphs1Q9QZS7 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nphs1Q9QZS7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nphs1Q9QZS7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nphs1Q9QZS7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nphs1Q9QZS7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nphs1Q9QZS7 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nphs1Q9QZS7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nphs1Q9QZS7 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nphs1Q9QZS7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nphs1Q9QZS7 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nphs1Q9QZS7 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nphs1Q9QZS7 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nphs1Q9QZS7 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nphs1Q9QZS7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nphs1Q9QZS7 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nphs1Q9QZS7 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nphs1Q9QZS7 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nphs1Q9QZS7 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nphs1Q9QZS7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nphs1Q9QZS7 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nphs1Q9QZS7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nphs1Q9QZS7 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nphs1Q9QZS7 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nphs1Q9QZS7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nphs1Q9QZS7 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nphs1Q9QZS7 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nphs1Q9QZS7 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nphs1Q9QZS7 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nphs1Q9QZS7 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nphs1Q9QZS7 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nphs1Q9QZS7 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nphs1Q9QZS7 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nphs1Q9QZS7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nphs1Q9QZS7 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nphs1Q9QZS7 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nphs1Q9QZS7 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Nphs1Q9QZS7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nphs1Q9QZS7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nphs1Q9QZS7 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nphs1Q9QZS7 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nphs1Q9QZS7 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nphs1Q9QZS7 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nphs1Q9QZS7 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nphs1Q9QZS7 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nphs1Q9QZS7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nphs1Q9QZS7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nphs1Q9QZS7 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nphs1Q9QZS7 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nphs1Q9QZS7 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nphs1Q9QZS7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nphs1Q9QZS7 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nphs1Q9QZS7 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nphs1Q9QZS7 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nphs1Q9QZS7 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nphs1Q9QZS7 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nphs1Q9QZS7 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nphs1Q9QZS7 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nphs1Q9QZS7 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nphs1Q9QZS7 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nphs1Q9QZS7 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nphs1Q9QZS7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nphs1Q9QZS7 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nphs1Q9QZS7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nphs1Q9QZS7 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nphs1Q9QZS7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nphs1Q9QZS7 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nphs1Q9QZS7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nphs1Q9QZS7 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nphs1Q9QZS7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nphs1Q9QZS7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nphs1Q9QZS7 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nphs1Q9QZS7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nphs1Q9QZS7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nphs1Q9QZS7 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nphs1Q9QZS7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nphs1Q9QZS7 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nphs1Q9QZS7 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nphs1Q9QZS7 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nphs1Q9QZS7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nphs1Q9QZS7 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nphs1Q9QZS7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nphs1Q9QZS7 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nphs1Q9QZS7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nphs1Q9QZS7 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms