Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
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