Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms