Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

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Length 557 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Gpc1Q9QZF2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Gpc1Q9QZF2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Gpc1Q9QZF2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Gpc1Q9QZF2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Gpc1Q9QZF2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Gpc1Q9QZF2 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Gpc1Q9QZF2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Gpc1Q9QZF2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Gpc1Q9QZF2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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