Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Copg1Q9QZE5 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Copg1Q9QZE5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Copg1Q9QZE5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Copg1Q9QZE5 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Copg1Q9QZE5 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Copg1Q9QZE5 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Copg1Q9QZE5 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Copg1Q9QZE5 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Copg1Q9QZE5 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Copg1Q9QZE5 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Copg1Q9QZE5 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Copg1Q9QZE5 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms