Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trpc3Q9QZC1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trpc3Q9QZC1 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Trpc3Q9QZC1 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Trpc3Q9QZC1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trpc3Q9QZC1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trpc3Q9QZC1 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trpc3Q9QZC1 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trpc3Q9QZC1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trpc3Q9QZC1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trpc3Q9QZC1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trpc3Q9QZC1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trpc3Q9QZC1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trpc3Q9QZC1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpc3Q9QZC1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpc3Q9QZC1 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpc3Q9QZC1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpc3Q9QZC1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpc3Q9QZC1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpc3Q9QZC1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpc3Q9QZC1 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpc3Q9QZC1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpc3Q9QZC1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpc3Q9QZC1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpc3Q9QZC1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpc3Q9QZC1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpc3Q9QZC1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpc3Q9QZC1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpc3Q9QZC1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpc3Q9QZC1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpc3Q9QZC1 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpc3Q9QZC1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trpc3Q9QZC1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trpc3Q9QZC1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trpc3Q9QZC1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trpc3Q9QZC1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trpc3Q9QZC1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trpc3Q9QZC1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Trpc3Q9QZC1 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trpc3Q9QZC1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trpc3Q9QZC1 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trpc3Q9QZC1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trpc3Q9QZC1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trpc3Q9QZC1 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trpc3Q9QZC1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trpc3Q9QZC1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trpc3Q9QZC1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trpc3Q9QZC1 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trpc3Q9QZC1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trpc3Q9QZC1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trpc3Q9QZC1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trpc3Q9QZC1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trpc3Q9QZC1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trpc3Q9QZC1 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trpc3Q9QZC1 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trpc3Q9QZC1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trpc3Q9QZC1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trpc3Q9QZC1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trpc3Q9QZC1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trpc3Q9QZC1 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trpc3Q9QZC1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trpc3Q9QZC1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trpc3Q9QZC1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trpc3Q9QZC1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trpc3Q9QZC1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trpc3Q9QZC1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Trpc3Q9QZC1 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trpc3Q9QZC1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trpc3Q9QZC1 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trpc3Q9QZC1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms