Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms