Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nr2e3Q9QXZ7 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nr2e3Q9QXZ7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nr2e3Q9QXZ7 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nr2e3Q9QXZ7 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nr2e3Q9QXZ7 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nr2e3Q9QXZ7 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nr2e3Q9QXZ7 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nr2e3Q9QXZ7 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nr2e3Q9QXZ7 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nr2e3Q9QXZ7 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nr2e3Q9QXZ7 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nr2e3Q9QXZ7 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nr2e3Q9QXZ7 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nr2e3Q9QXZ7 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nr2e3Q9QXZ7 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nr2e3Q9QXZ7 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nr2e3Q9QXZ7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nr2e3Q9QXZ7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nr2e3Q9QXZ7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nr2e3Q9QXZ7 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nr2e3Q9QXZ7 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nr2e3Q9QXZ7 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nr2e3Q9QXZ7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nr2e3Q9QXZ7 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nr2e3Q9QXZ7 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nr2e3Q9QXZ7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nr2e3Q9QXZ7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nr2e3Q9QXZ7 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nr2e3Q9QXZ7 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nr2e3Q9QXZ7 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nr2e3Q9QXZ7 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nr2e3Q9QXZ7 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nr2e3Q9QXZ7 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nr2e3Q9QXZ7 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nr2e3Q9QXZ7 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nr2e3Q9QXZ7 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nr2e3Q9QXZ7 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nr2e3Q9QXZ7 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nr2e3Q9QXZ7 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Nr2e3Q9QXZ7 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nr2e3Q9QXZ7 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nr2e3Q9QXZ7 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nr2e3Q9QXZ7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nr2e3Q9QXZ7 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Nr2e3Q9QXZ7 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms