Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms