Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

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Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Kcnip3Q9QXT8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kcnip3Q9QXT8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kcnip3Q9QXT8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kcnip3Q9QXT8 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kcnip3Q9QXT8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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