Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK3

Copg2, Coatomer subunit gamma-2, mousemouse

Predictions only

Length 871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg2Q9QXK3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Copg2Q9QXK3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Copg2Q9QXK3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Copg2Q9QXK3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Copg2Q9QXK3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Copg2Q9QXK3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Copg2Q9QXK3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Copg2Q9QXK3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Copg2Q9QXK3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Copg2Q9QXK3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Copg2Q9QXK3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Copg2Q9QXK3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Copg2Q9QXK3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Copg2Q9QXK3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Copg2Q9QXK3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Copg2Q9QXK3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Copg2Q9QXK3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Copg2Q9QXK3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Copg2Q9QXK3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Copg2Q9QXK3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Copg2Q9QXK3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Copg2Q9QXK3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Copg2Q9QXK3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Copg2Q9QXK3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Copg2Q9QXK3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Copg2Q9QXK3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Copg2Q9QXK3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Copg2Q9QXK3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Copg2Q9QXK3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Copg2Q9QXK3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Copg2Q9QXK3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Copg2Q9QXK3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Copg2Q9QXK3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Copg2Q9QXK3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Copg2Q9QXK3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms