Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK2

Rad18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad18Q9QXK2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms