Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rai2Q9QVY8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms