Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms