Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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