Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM99

Prg4, Proteoglycan 4, mousemouse

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Length 1,054 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg4Q9JM99 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prg4Q9JM99 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prg4Q9JM99 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prg4Q9JM99 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prg4Q9JM99 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prg4Q9JM99 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prg4Q9JM99 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prg4Q9JM99 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prg4Q9JM99 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prg4Q9JM99 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prg4Q9JM99 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prg4Q9JM99 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prg4Q9JM99 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prg4Q9JM99 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prg4Q9JM99 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Prg4Q9JM99 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prg4Q9JM99 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prg4Q9JM99 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prg4Q9JM99 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prg4Q9JM99 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prg4Q9JM99 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prg4Q9JM99 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prg4Q9JM99 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prg4Q9JM99 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prg4Q9JM99 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prg4Q9JM99 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prg4Q9JM99 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prg4Q9JM99 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prg4Q9JM99 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prg4Q9JM99 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prg4Q9JM99 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prg4Q9JM99 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prg4Q9JM99 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prg4Q9JM99 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prg4Q9JM99 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prg4Q9JM99 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Prg4Q9JM99 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prg4Q9JM99 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Prg4Q9JM99 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prg4Q9JM99 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prg4Q9JM99 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prg4Q9JM99 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prg4Q9JM99 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prg4Q9JM99 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prg4Q9JM99 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prg4Q9JM99 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prg4Q9JM99 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prg4Q9JM99 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prg4Q9JM99 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prg4Q9JM99 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prg4Q9JM99 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prg4Q9JM99 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prg4Q9JM99 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prg4Q9JM99 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prg4Q9JM99 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prg4Q9JM99 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prg4Q9JM99 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prg4Q9JM99 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prg4Q9JM99 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prg4Q9JM99 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prg4Q9JM99 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prg4Q9JM99 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prg4Q9JM99 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prg4Q9JM99 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prg4Q9JM99 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prg4Q9JM99 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prg4Q9JM99 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prg4Q9JM99 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prg4Q9JM99 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prg4Q9JM99 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prg4Q9JM99 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prg4Q9JM99 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prg4Q9JM99 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prg4Q9JM99 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prg4Q9JM99 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prg4Q9JM99 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prg4Q9JM99 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prg4Q9JM99 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prg4Q9JM99 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prg4Q9JM99 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prg4Q9JM99 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prg4Q9JM99 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prg4Q9JM99 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prg4Q9JM99 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prg4Q9JM99 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prg4Q9JM99 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prg4Q9JM99 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prg4Q9JM99 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prg4Q9JM99 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prg4Q9JM99 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prg4Q9JM99 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Prg4Q9JM99 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prg4Q9JM99 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prg4Q9JM99 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Prg4Q9JM99 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prg4Q9JM99 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Prg4Q9JM99 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prg4Q9JM99 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prg4Q9JM99 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prg4Q9JM99 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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