Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rabgef1Q9JM13 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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