Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLJ2

Aldh9a1, 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh9a1Q9JLJ2 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Aldh9a1Q9JLJ2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Aldh9a1Q9JLJ2 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms