Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLH8

Tmod4, Tropomodulin-4, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod4Q9JLH8 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
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Tmod4Q9JLH8 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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Tmod4Q9JLH8 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
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Tmod4Q9JLH8 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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Tmod4Q9JLH8 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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