Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms