Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL95

Prg3, Proteoglycan 3, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg3Q9JL95 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prg3Q9JL95 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms