Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL18

Bace2, Beta-secretase 2, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace2Q9JL18 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bace2Q9JL18 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms