Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot9Q9JKY0 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot9Q9JKY0 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot9Q9JKY0 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot9Q9JKY0 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot9Q9JKY0 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot9Q9JKY0 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot9Q9JKY0 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot9Q9JKY0 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot9Q9JKY0 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot9Q9JKY0 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot9Q9JKY0 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot9Q9JKY0 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot9Q9JKY0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cnot9Q9JKY0 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot9Q9JKY0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot9Q9JKY0 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot9Q9JKY0 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot9Q9JKY0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot9Q9JKY0 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot9Q9JKY0 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot9Q9JKY0 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot9Q9JKY0 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot9Q9JKY0 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot9Q9JKY0 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot9Q9JKY0 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cnot9Q9JKY0 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cnot9Q9JKY0 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cnot9Q9JKY0 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cnot9Q9JKY0 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cnot9Q9JKY0 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cnot9Q9JKY0 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cnot9Q9JKY0 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cnot9Q9JKY0 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cnot9Q9JKY0 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Cnot9Q9JKY0 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cnot9Q9JKY0 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cnot9Q9JKY0 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Cnot9Q9JKY0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cnot9Q9JKY0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cnot9Q9JKY0 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cnot9Q9JKY0 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot9Q9JKY0 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms