Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ldb3Q9JKS4 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ldb3Q9JKS4 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ldb3Q9JKS4 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ldb3Q9JKS4 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ldb3Q9JKS4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ldb3Q9JKS4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ldb3Q9JKS4 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ldb3Q9JKS4 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ldb3Q9JKS4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ldb3Q9JKS4 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ldb3Q9JKS4 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ldb3Q9JKS4 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ldb3Q9JKS4 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ldb3Q9JKS4 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ldb3Q9JKS4 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ldb3Q9JKS4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ldb3Q9JKS4 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ldb3Q9JKS4 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ldb3Q9JKS4 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Ldb3Q9JKS4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ldb3Q9JKS4 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ldb3Q9JKS4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ldb3Q9JKS4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ldb3Q9JKS4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ldb3Q9JKS4 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ldb3Q9JKS4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ldb3Q9JKS4 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ldb3Q9JKS4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms