Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chrac1Q9JKP8 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms