Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKN6

Nova1, RNA-binding protein Nova-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nova1Q9JKN6 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms