Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKL1

Prokr1, Prokineticin receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prokr1Q9JKL1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prokr1Q9JKL1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prokr1Q9JKL1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prokr1Q9JKL1 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prokr1Q9JKL1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prokr1Q9JKL1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prokr1Q9JKL1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prokr1Q9JKL1 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prokr1Q9JKL1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prokr1Q9JKL1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prokr1Q9JKL1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prokr1Q9JKL1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prokr1Q9JKL1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prokr1Q9JKL1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prokr1Q9JKL1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prokr1Q9JKL1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prokr1Q9JKL1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prokr1Q9JKL1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prokr1Q9JKL1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prokr1Q9JKL1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prokr1Q9JKL1 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prokr1Q9JKL1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prokr1Q9JKL1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prokr1Q9JKL1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prokr1Q9JKL1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prokr1Q9JKL1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prokr1Q9JKL1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prokr1Q9JKL1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prokr1Q9JKL1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prokr1Q9JKL1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prokr1Q9JKL1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prokr1Q9JKL1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prokr1Q9JKL1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prokr1Q9JKL1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prokr1Q9JKL1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prokr1Q9JKL1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prokr1Q9JKL1 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prokr1Q9JKL1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prokr1Q9JKL1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prokr1Q9JKL1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prokr1Q9JKL1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prokr1Q9JKL1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Prokr1Q9JKL1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prokr1Q9JKL1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prokr1Q9JKL1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prokr1Q9JKL1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prokr1Q9JKL1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prokr1Q9JKL1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Prokr1Q9JKL1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prokr1Q9JKL1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prokr1Q9JKL1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prokr1Q9JKL1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prokr1Q9JKL1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prokr1Q9JKL1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prokr1Q9JKL1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prokr1Q9JKL1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prokr1Q9JKL1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prokr1Q9JKL1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prokr1Q9JKL1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prokr1Q9JKL1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prokr1Q9JKL1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prokr1Q9JKL1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prokr1Q9JKL1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prokr1Q9JKL1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prokr1Q9JKL1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prokr1Q9JKL1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prokr1Q9JKL1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prokr1Q9JKL1 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Prokr1Q9JKL1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Prokr1Q9JKL1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prokr1Q9JKL1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prokr1Q9JKL1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prokr1Q9JKL1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prokr1Q9JKL1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prokr1Q9JKL1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prokr1Q9JKL1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Prokr1Q9JKL1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prokr1Q9JKL1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prokr1Q9JKL1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prokr1Q9JKL1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prokr1Q9JKL1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prokr1Q9JKL1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prokr1Q9JKL1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prokr1Q9JKL1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prokr1Q9JKL1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prokr1Q9JKL1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prokr1Q9JKL1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prokr1Q9JKL1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prokr1Q9JKL1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prokr1Q9JKL1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prokr1Q9JKL1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prokr1Q9JKL1 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Prokr1Q9JKL1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Prokr1Q9JKL1 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Prokr1Q9JKL1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prokr1Q9JKL1 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Prokr1Q9JKL1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prokr1Q9JKL1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prokr1Q9JKL1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prokr1Q9JKL1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms