Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms