Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ybx3Q9JKB3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ybx3Q9JKB3 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ybx3Q9JKB3 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ybx3Q9JKB3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ybx3Q9JKB3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ybx3Q9JKB3 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ybx3Q9JKB3 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ybx3Q9JKB3 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ybx3Q9JKB3 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ybx3Q9JKB3 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ybx3Q9JKB3 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ybx3Q9JKB3 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ybx3Q9JKB3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ybx3Q9JKB3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ybx3Q9JKB3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ybx3Q9JKB3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ybx3Q9JKB3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ybx3Q9JKB3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ybx3Q9JKB3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ybx3Q9JKB3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ybx3Q9JKB3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ybx3Q9JKB3 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ybx3Q9JKB3 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ybx3Q9JKB3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ybx3Q9JKB3 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ybx3Q9JKB3 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ybx3Q9JKB3 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ybx3Q9JKB3 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ybx3Q9JKB3 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ybx3Q9JKB3 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ybx3Q9JKB3 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ybx3Q9JKB3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ybx3Q9JKB3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ybx3Q9JKB3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ybx3Q9JKB3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ybx3Q9JKB3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ybx3Q9JKB3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ybx3Q9JKB3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ybx3Q9JKB3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ybx3Q9JKB3 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ybx3Q9JKB3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ybx3Q9JKB3 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ybx3Q9JKB3 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ybx3Q9JKB3 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ybx3Q9JKB3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ybx3Q9JKB3 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ybx3Q9JKB3 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ybx3Q9JKB3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ybx3Q9JKB3 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ybx3Q9JKB3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ybx3Q9JKB3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ybx3Q9JKB3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms