Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK48

Sh3glb1, Endophilin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3glb1Q9JK48 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms