Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJW6

Alyref2, Aly/REF export factor 2, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alyref2Q9JJW6 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Alyref2Q9JJW6 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Alyref2Q9JJW6 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Alyref2Q9JJW6 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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