Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJU8

Sh3bgrl, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrlQ9JJU8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Sh3bgrlQ9JJU8 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Sh3bgrlQ9JJU8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Sh3bgrlQ9JJU8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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Sh3bgrlQ9JJU8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Sh3bgrlQ9JJU8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Sh3bgrlQ9JJU8 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Sh3bgrlQ9JJU8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Sh3bgrlQ9JJU8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Sh3bgrlQ9JJU8 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh3bgrlQ9JJU8 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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