Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Riox1Q9JJF3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms