Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL4

Pdzk1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF3, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1Q9JIL4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pdzk1Q9JIL4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms