Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIC3

Dclre1a, DNA cross-link repair 1A protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1aQ9JIC3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dclre1aQ9JIC3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dclre1aQ9JIC3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dclre1aQ9JIC3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dclre1aQ9JIC3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dclre1aQ9JIC3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dclre1aQ9JIC3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dclre1aQ9JIC3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dclre1aQ9JIC3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Dclre1aQ9JIC3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dclre1aQ9JIC3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dclre1aQ9JIC3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dclre1aQ9JIC3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dclre1aQ9JIC3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dclre1aQ9JIC3 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dclre1aQ9JIC3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dclre1aQ9JIC3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dclre1aQ9JIC3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dclre1aQ9JIC3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dclre1aQ9JIC3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dclre1aQ9JIC3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dclre1aQ9JIC3 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Dclre1aQ9JIC3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dclre1aQ9JIC3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dclre1aQ9JIC3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dclre1aQ9JIC3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dclre1aQ9JIC3 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dclre1aQ9JIC3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dclre1aQ9JIC3 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dclre1aQ9JIC3 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dclre1aQ9JIC3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dclre1aQ9JIC3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dclre1aQ9JIC3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dclre1aQ9JIC3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dclre1aQ9JIC3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Dclre1aQ9JIC3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Dclre1aQ9JIC3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dclre1aQ9JIC3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dclre1aQ9JIC3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dclre1aQ9JIC3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dclre1aQ9JIC3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dclre1aQ9JIC3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Dclre1aQ9JIC3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dclre1aQ9JIC3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dclre1aQ9JIC3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dclre1aQ9JIC3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dclre1aQ9JIC3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dclre1aQ9JIC3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dclre1aQ9JIC3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dclre1aQ9JIC3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dclre1aQ9JIC3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dclre1aQ9JIC3 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dclre1aQ9JIC3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dclre1aQ9JIC3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dclre1aQ9JIC3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dclre1aQ9JIC3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dclre1aQ9JIC3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dclre1aQ9JIC3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dclre1aQ9JIC3 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dclre1aQ9JIC3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dclre1aQ9JIC3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dclre1aQ9JIC3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dclre1aQ9JIC3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dclre1aQ9JIC3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dclre1aQ9JIC3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dclre1aQ9JIC3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dclre1aQ9JIC3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Dclre1aQ9JIC3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dclre1aQ9JIC3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dclre1aQ9JIC3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dclre1aQ9JIC3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dclre1aQ9JIC3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dclre1aQ9JIC3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dclre1aQ9JIC3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dclre1aQ9JIC3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dclre1aQ9JIC3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dclre1aQ9JIC3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dclre1aQ9JIC3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dclre1aQ9JIC3 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dclre1aQ9JIC3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dclre1aQ9JIC3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dclre1aQ9JIC3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dclre1aQ9JIC3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dclre1aQ9JIC3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms