Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf2ird1Q9JI57 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms