Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tcirg1Q9JHF5 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms