Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET54

Palld, Palladin, mousemouse

Predictions only

Length 1,408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PalldQ9ET54 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PalldQ9ET54 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PalldQ9ET54 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PalldQ9ET54 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PalldQ9ET54 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PalldQ9ET54 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PalldQ9ET54 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PalldQ9ET54 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PalldQ9ET54 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PalldQ9ET54 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PalldQ9ET54 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PalldQ9ET54 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PalldQ9ET54 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PalldQ9ET54 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PalldQ9ET54 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PalldQ9ET54 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PalldQ9ET54 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PalldQ9ET54 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PalldQ9ET54 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PalldQ9ET54 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PalldQ9ET54 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PalldQ9ET54 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PalldQ9ET54 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PalldQ9ET54 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PalldQ9ET54 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PalldQ9ET54 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PalldQ9ET54 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PalldQ9ET54 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PalldQ9ET54 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PalldQ9ET54 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PalldQ9ET54 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PalldQ9ET54 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PalldQ9ET54 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PalldQ9ET54 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PalldQ9ET54 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PalldQ9ET54 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PalldQ9ET54 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PalldQ9ET54 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PalldQ9ET54 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PalldQ9ET54 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PalldQ9ET54 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PalldQ9ET54 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PalldQ9ET54 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PalldQ9ET54 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PalldQ9ET54 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PalldQ9ET54 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PalldQ9ET54 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PalldQ9ET54 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PalldQ9ET54 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PalldQ9ET54 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PalldQ9ET54 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PalldQ9ET54 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PalldQ9ET54 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PalldQ9ET54 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PalldQ9ET54 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PalldQ9ET54 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PalldQ9ET54 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PalldQ9ET54 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PalldQ9ET54 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PalldQ9ET54 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PalldQ9ET54 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PalldQ9ET54 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PalldQ9ET54 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PalldQ9ET54 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PalldQ9ET54 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PalldQ9ET54 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PalldQ9ET54 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PalldQ9ET54 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PalldQ9ET54 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PalldQ9ET54 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PalldQ9ET54 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PalldQ9ET54 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PalldQ9ET54 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PalldQ9ET54 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PalldQ9ET54 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PalldQ9ET54 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PalldQ9ET54 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PalldQ9ET54 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PalldQ9ET54 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PalldQ9ET54 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PalldQ9ET54 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PalldQ9ET54 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PalldQ9ET54 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PalldQ9ET54 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PalldQ9ET54 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PalldQ9ET54 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PalldQ9ET54 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PalldQ9ET54 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PalldQ9ET54 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PalldQ9ET54 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PalldQ9ET54 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PalldQ9ET54 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PalldQ9ET54 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PalldQ9ET54 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PalldQ9ET54 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PalldQ9ET54 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PalldQ9ET54 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PalldQ9ET54 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PalldQ9ET54 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PalldQ9ET54 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms