Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET30

Tm9sf3, Transmembrane 9 superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf3Q9ET30 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tm9sf3Q9ET30 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tm9sf3Q9ET30 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms