Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Rb1cc1Q9ESK9 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Rb1cc1Q9ESK9 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Rb1cc1Q9ESK9 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Rb1cc1Q9ESK9 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Rb1cc1Q9ESK9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.32
Rb1cc1Q9ESK9 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rb1cc1Q9ESK9 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rb1cc1Q9ESK9 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Rb1cc1Q9ESK9 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rb1cc1Q9ESK9 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rb1cc1Q9ESK9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rb1cc1Q9ESK9 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rb1cc1Q9ESK9 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rb1cc1Q9ESK9 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rb1cc1Q9ESK9 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rb1cc1Q9ESK9 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rb1cc1Q9ESK9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rb1cc1Q9ESK9 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rb1cc1Q9ESK9 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rb1cc1Q9ESK9 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rb1cc1Q9ESK9 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rb1cc1Q9ESK9 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rb1cc1Q9ESK9 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rb1cc1Q9ESK9 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rb1cc1Q9ESK9 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rb1cc1Q9ESK9 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rb1cc1Q9ESK9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rb1cc1Q9ESK9 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Rb1cc1Q9ESK9 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Rb1cc1Q9ESK9 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Rb1cc1Q9ESK9 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rb1cc1Q9ESK9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rb1cc1Q9ESK9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rb1cc1Q9ESK9 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rb1cc1Q9ESK9 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rb1cc1Q9ESK9 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rb1cc1Q9ESK9 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rb1cc1Q9ESK9 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rb1cc1Q9ESK9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rb1cc1Q9ESK9 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rb1cc1Q9ESK9 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rb1cc1Q9ESK9 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rb1cc1Q9ESK9 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rb1cc1Q9ESK9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rb1cc1Q9ESK9 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rb1cc1Q9ESK9 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rb1cc1Q9ESK9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rb1cc1Q9ESK9 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rb1cc1Q9ESK9 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rb1cc1Q9ESK9 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rb1cc1Q9ESK9 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Rb1cc1Q9ESK9 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rb1cc1Q9ESK9 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Rb1cc1Q9ESK9 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Rb1cc1Q9ESK9 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Rb1cc1Q9ESK9 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Rb1cc1Q9ESK9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Rb1cc1Q9ESK9 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Rb1cc1Q9ESK9 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Rb1cc1Q9ESK9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Rb1cc1Q9ESK9 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Rb1cc1Q9ESK9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Rb1cc1Q9ESK9 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Rb1cc1Q9ESK9 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Rb1cc1Q9ESK9 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Rb1cc1Q9ESK9 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Rb1cc1Q9ESK9 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Rb1cc1Q9ESK9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Rb1cc1Q9ESK9 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Rb1cc1Q9ESK9 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rb1cc1Q9ESK9 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rb1cc1Q9ESK9 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rb1cc1Q9ESK9 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rb1cc1Q9ESK9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rb1cc1Q9ESK9 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rb1cc1Q9ESK9 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rb1cc1Q9ESK9 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rb1cc1Q9ESK9 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rb1cc1Q9ESK9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rb1cc1Q9ESK9 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rb1cc1Q9ESK9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rb1cc1Q9ESK9 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rb1cc1Q9ESK9 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms