Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERT2

Trhr2, Thyrotropin-releasing hormone receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trhr2Q9ERT2 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trhr2Q9ERT2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms