Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERD7

Tubb3, Tubulin beta-3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb3Q9ERD7 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tubb3Q9ERD7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb3Q9ERD7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms