Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms