Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER05

Ctrl, Chymopasin, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtrlQ9ER05 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CtrlQ9ER05 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms