Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SgshQ9EQ08 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms