Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL5

Mmp1a, Interstitial collagenase A, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp1aQ9EPL5 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mmp1aQ9EPL5 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Mmp1aQ9EPL5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mmp1aQ9EPL5 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mmp1aQ9EPL5 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp1aQ9EPL5 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp1aQ9EPL5 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp1aQ9EPL5 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp1aQ9EPL5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp1aQ9EPL5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp1aQ9EPL5 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp1aQ9EPL5 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp1aQ9EPL5 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp1aQ9EPL5 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp1aQ9EPL5 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp1aQ9EPL5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp1aQ9EPL5 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp1aQ9EPL5 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp1aQ9EPL5 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp1aQ9EPL5 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp1aQ9EPL5 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp1aQ9EPL5 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp1aQ9EPL5 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp1aQ9EPL5 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp1aQ9EPL5 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp1aQ9EPL5 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp1aQ9EPL5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp1aQ9EPL5 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp1aQ9EPL5 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp1aQ9EPL5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp1aQ9EPL5 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp1aQ9EPL5 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp1aQ9EPL5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp1aQ9EPL5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp1aQ9EPL5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp1aQ9EPL5 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp1aQ9EPL5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp1aQ9EPL5 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp1aQ9EPL5 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp1aQ9EPL5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp1aQ9EPL5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp1aQ9EPL5 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp1aQ9EPL5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp1aQ9EPL5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp1aQ9EPL5 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp1aQ9EPL5 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp1aQ9EPL5 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp1aQ9EPL5 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp1aQ9EPL5 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp1aQ9EPL5 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp1aQ9EPL5 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp1aQ9EPL5 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp1aQ9EPL5 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp1aQ9EPL5 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp1aQ9EPL5 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp1aQ9EPL5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp1aQ9EPL5 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp1aQ9EPL5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp1aQ9EPL5 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp1aQ9EPL5 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp1aQ9EPL5 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp1aQ9EPL5 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp1aQ9EPL5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp1aQ9EPL5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp1aQ9EPL5 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp1aQ9EPL5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp1aQ9EPL5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp1aQ9EPL5 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp1aQ9EPL5 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp1aQ9EPL5 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp1aQ9EPL5 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp1aQ9EPL5 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp1aQ9EPL5 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp1aQ9EPL5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp1aQ9EPL5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp1aQ9EPL5 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms