Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC53

Cpne8, Copine-8, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne8Q9DC53 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms