Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBM0

Abcg8, ATP-binding cassette sub-family G member 8, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg8Q9DBM0 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Abcg8Q9DBM0 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Abcg8Q9DBM0 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Abcg8Q9DBM0 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Abcg8Q9DBM0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Abcg8Q9DBM0 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Abcg8Q9DBM0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Abcg8Q9DBM0 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Abcg8Q9DBM0 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Abcg8Q9DBM0 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Abcg8Q9DBM0 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Abcg8Q9DBM0 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms