Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB94

Wdr53, WD repeat-containing protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr53Q9DB94 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wdr53Q9DB94 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wdr53Q9DB94 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wdr53Q9DB94 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wdr53Q9DB94 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wdr53Q9DB94 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wdr53Q9DB94 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wdr53Q9DB94 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wdr53Q9DB94 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wdr53Q9DB94 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wdr53Q9DB94 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Wdr53Q9DB94 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Wdr53Q9DB94 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Wdr53Q9DB94 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Wdr53Q9DB94 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Wdr53Q9DB94 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Wdr53Q9DB94 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Wdr53Q9DB94 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Wdr53Q9DB94 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Wdr53Q9DB94 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Wdr53Q9DB94 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Wdr53Q9DB94 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Wdr53Q9DB94 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Wdr53Q9DB94 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Wdr53Q9DB94 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Wdr53Q9DB94 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Wdr53Q9DB94 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Wdr53Q9DB94 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Wdr53Q9DB94 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Wdr53Q9DB94 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wdr53Q9DB94 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wdr53Q9DB94 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wdr53Q9DB94 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Wdr53Q9DB94 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wdr53Q9DB94 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wdr53Q9DB94 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Wdr53Q9DB94 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wdr53Q9DB94 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wdr53Q9DB94 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wdr53Q9DB94 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wdr53Q9DB94 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wdr53Q9DB94 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wdr53Q9DB94 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wdr53Q9DB94 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wdr53Q9DB94 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wdr53Q9DB94 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wdr53Q9DB94 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wdr53Q9DB94 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Wdr53Q9DB94 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Wdr53Q9DB94 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Wdr53Q9DB94 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Wdr53Q9DB94 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Wdr53Q9DB94 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Wdr53Q9DB94 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Wdr53Q9DB94 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Wdr53Q9DB94 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Wdr53Q9DB94 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Wdr53Q9DB94 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Wdr53Q9DB94 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Wdr53Q9DB94 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Wdr53Q9DB94 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Wdr53Q9DB94 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Wdr53Q9DB94 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Wdr53Q9DB94 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Wdr53Q9DB94 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Wdr53Q9DB94 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Wdr53Q9DB94 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Wdr53Q9DB94 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Wdr53Q9DB94 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Wdr53Q9DB94 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Wdr53Q9DB94 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Wdr53Q9DB94 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Wdr53Q9DB94 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Wdr53Q9DB94 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Wdr53Q9DB94 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Wdr53Q9DB94 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Wdr53Q9DB94 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Wdr53Q9DB94 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Wdr53Q9DB94 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Wdr53Q9DB94 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Wdr53Q9DB94 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Wdr53Q9DB94 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Wdr53Q9DB94 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Wdr53Q9DB94 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Wdr53Q9DB94 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Wdr53Q9DB94 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Wdr53Q9DB94 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Wdr53Q9DB94 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Wdr53Q9DB94 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Wdr53Q9DB94 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Wdr53Q9DB94 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Wdr53Q9DB94 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Wdr53Q9DB94 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Wdr53Q9DB94 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Wdr53Q9DB94 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Wdr53Q9DB94 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Wdr53Q9DB94 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Wdr53Q9DB94 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Wdr53Q9DB94 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Wdr53Q9DB94 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms