Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med27Q9DB40 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med27Q9DB40 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med27Q9DB40 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med27Q9DB40 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med27Q9DB40 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med27Q9DB40 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med27Q9DB40 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med27Q9DB40 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med27Q9DB40 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med27Q9DB40 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med27Q9DB40 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med27Q9DB40 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med27Q9DB40 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med27Q9DB40 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Med27Q9DB40 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med27Q9DB40 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med27Q9DB40 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med27Q9DB40 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med27Q9DB40 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med27Q9DB40 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med27Q9DB40 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med27Q9DB40 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med27Q9DB40 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med27Q9DB40 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med27Q9DB40 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med27Q9DB40 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med27Q9DB40 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med27Q9DB40 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med27Q9DB40 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med27Q9DB40 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med27Q9DB40 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med27Q9DB40 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med27Q9DB40 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Med27Q9DB40 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med27Q9DB40 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Med27Q9DB40 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med27Q9DB40 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Med27Q9DB40 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med27Q9DB40 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med27Q9DB40 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med27Q9DB40 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Med27Q9DB40 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med27Q9DB40 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med27Q9DB40 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med27Q9DB40 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med27Q9DB40 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med27Q9DB40 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med27Q9DB40 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med27Q9DB40 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med27Q9DB40 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med27Q9DB40 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med27Q9DB40 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Med27Q9DB40 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Med27Q9DB40 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Med27Q9DB40 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Med27Q9DB40 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med27Q9DB40 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms